238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3268 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3268  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1331    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000411591 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3579  hypothetical protein  47.81 
 
 		 648 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0356555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1910  hypothetical protein  43.87 
 
 		 653 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0703624  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  41.67 
 
 		 503 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0165  hypothetical protein  43.62 
 
 		 649 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.18 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  31.96 
 
 		 498 aa  268  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  33.19 
 
 		 494 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  33.94 
 
 		 504 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  33.94 
 
 		 504 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  33.94 
 
 		 504 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  35.56 
 
 		 500 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  33.74 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  33.74 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  33.4 
 
 		 508 aa  243  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.39 
 
 		 493 aa  236  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  34.84 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  34.22 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.18 
 
 		 502 aa  234  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.704493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  32.8 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.73 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  32.93 
 
 		 496 aa  231  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  31.3 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  31.1 
 
 		 504 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  32.28 
 
 		 509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  30.37 
 
 		 507 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  30.78 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  30.54 
 
 		 490 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.64 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.76 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1455  hypothetical protein  33.19 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.265608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  31.01 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  30.74 
 
 		 504 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4226  hypothetical protein  31.5 
 
 		 512 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0723732  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 		 496 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  32.67 
 
 		 496 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  31.35 
 
 		 506 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  32.67 
 
 		 496 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.35 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  31.35 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  31.35 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  31.35 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  31.16 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  30.38 
 
 		 504 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.96 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  28.87 
 
 		 498 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  33.62 
 
 		 505 aa  221  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.94 
 
 		 503 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  30.02 
 
 		 515 aa  221  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  31.4 
 
 		 506 aa  220  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.95 
 
 		 536 aa  220  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.94 
 
 		 497 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  29.93 
 
 		 513 aa  220  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  30.6 
 
 		 504 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  31.25 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.12 
 
 		 536 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4435  hypothetical protein  31.47 
 
 		 495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  32.3 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.43 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  29.96 
 
 		 500 aa  218  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  30.48 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  30.89 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  32.85 
 
 		 508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  31.73 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  30.86 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.43 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  29.54 
 
 		 519 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  33.56 
 
 		 504 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  30.9 
 
 		 506 aa  213  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  30.91 
 
 		 499 aa  213  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  31.13 
 
 		 503 aa  213  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.74 
 
 		 505 aa  213  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.52 
 
 		 506 aa  212  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  27.9 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  28.12 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  31.87 
 
 		 504 aa  210  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  33.26 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2583  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.45 
 
 		 497 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  31.98 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  33.26 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  31.06 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  31.03 
 
 		 508 aa  207  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  30.06 
 
 		 515 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  30.72 
 
 		 506 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.88 
 
 		 503 aa  206  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  29.12 
 
 		 531 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  27.59 
 
 		 502 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  31.87 
 
 		 501 aa  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  29.74 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  29.25 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1844  hypothetical protein  32.41 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0173985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  28.78 
 
 		 503 aa  205  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  28.88 
 
 		 503 aa  204  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  29.24 
 
 		 505 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  30.53 
 
 		 506 aa  204  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  29.51 
 
 		 539 aa  204  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  30.65 
 
 		 508 aa  204  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  29.74 
 
 		 509 aa  203  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  28.45 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>