58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1333 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  820    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.554888  normal  0.392861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1853  hypothetical protein  36.36 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.60785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0940  hypothetical protein  38.02 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  25.47 
 
 		 1346 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.47 
 
 		 1374 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  30.4 
 
 		 692 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.76 
 
 		 1054 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  26.02 
 
 		 1017 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  25.31 
 
 		 1194 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  24.71 
 
 		 1070 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 1226 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.12 
 
 		 1486 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  29.93 
 
 		 1414 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  23.75 
 
 		 1344 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  29.31 
 
 		 1070 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  21.8 
 
 		 1093 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.09 
 
 		 1086 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  25.94 
 
 		 1407 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  28.97 
 
 		 1370 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 1453 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  31.45 
 
 		 1008 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.67 
 
 		 1430 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.017718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1476  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.67 
 
 		 1430 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65929  normal  0.14467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  21.81 
 
 		 1351 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.65 
 
 		 1185 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  27.67 
 
 		 1355 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  22.81 
 
 		 1374 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3774  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.71 
 
 		 1487 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  27.74 
 
 		 1502 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  33.77 
 
 		 1342 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  21.83 
 
 		 1340 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  20.19 
 
 		 1400 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  30.77 
 
 		 976 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.95 
 
 		 1508 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.95 
 
 		 1508 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  34.67 
 
 		 1021 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  20.93 
 
 		 1355 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.95 
 
 		 1508 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.95 
 
 		 1508 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.73 
 
 		 965 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1532  GGDEF domain-containing protein  27.43 
 
 		 1450 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  36.62 
 
 		 1175 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 1258 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  25.84 
 
 		 1105 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  27.64 
 
 		 1093 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  35.62 
 
 		 1024 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  26.09 
 
 		 1311 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  33.75 
 
 		 977 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  34.19 
 
 		 967 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1464  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.9 
 
 		 1433 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0230  two-component sensor histidine kinase/response regulator  30.34 
 
 		 177 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.949413  normal  0.193124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  28.1 
 
 		 1363 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  32.95 
 
 		 534 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 		 1181 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3084  sensory box protein  25.45 
 
 		 1422 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  32 
 
 		 1191 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  31.58 
 
 		 1418 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  23.58 
 
 		 1141 aa  42.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>