46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1853 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  786    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.60785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1333  hypothetical protein  39.74 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.554888  normal  0.392861 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0940  hypothetical protein  36.94 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.31 
 
 		 1374 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 1453 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 1258 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  26.29 
 
 		 1185 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  24.91 
 
 		 692 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.67 
 
 		 1346 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  20.17 
 
 		 1347 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.6 
 
 		 1070 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  20 
 
 		 1313 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  22.53 
 
 		 1278 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  34.67 
 
 		 1334 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  22.13 
 
 		 1141 aa  49.7  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  25.51 
 
 		 695 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  23.99 
 
 		 1327 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  25.31 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.07 
 
 		 1342 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  30.26 
 
 		 1179 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  30.26 
 
 		 1190 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.01 
 
 		 1070 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.63 
 
 		 1105 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  23.95 
 
 		 1407 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01021  sensory box/GGDEF/EAL domain protein  33.33 
 
 		 1392 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 1349 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  22.08 
 
 		 1054 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  30.19 
 
 		 1526 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00965  Putative signal protein with GGDEF domain  26.41 
 
 		 973 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.051643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06201  Putative signal protein with GGDEF domain  26.41 
 
 		 973 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  20.82 
 
 		 1363 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.34 
 
 		 1079 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22.07 
 
 		 1378 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  20.65 
 
 		 1400 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  20.99 
 
 		 1093 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  23.9 
 
 		 1191 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  21.17 
 
 		 1378 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  34.18 
 
 		 1376 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.6 
 
 		 1118 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  31.51 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  32.2 
 
 		 1024 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.96 
 
 		 1505 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.14 
 
 		 1086 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  24.9 
 
 		 990 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  24.9 
 
 		 990 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  19.69 
 
 		 1324 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>