233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3243 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3243  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 101 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0695939 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0035  large conductance mechanosensitive channel protein  63.37 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262039  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2600  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  43.56 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0031  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  44 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.840685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1490  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  48.48 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.105065 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  40.38 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  34.69 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  36 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  38.38 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  36.27 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  34.31 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  38.24 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  37.11 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2038  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499106 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  35.87 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  35.4 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  40.23 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  34.78 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  35.05 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  34.74 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  31.62 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  36.19 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  33.64 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  32.46 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  30.51 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  32.52 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  32.76 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  30.63 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  32.14 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  34.26 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  30.17 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2277  large-conductive mechanosensitive channel  30.39 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.589434  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  31.63 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  32.2 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  32.46 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  35.71 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  32 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  29.36 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  31.62 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  29.25 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  33.64 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  29.25 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  27.1 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  29.91 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  31.48 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  32.76 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  37.8 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  31.11 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  33.93 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  27.35 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  29.25 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  33.04 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  30.77 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  31.31 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02405  large conductance mechanosensitive channel protein  31.3 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.914683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  31.82 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  28.3 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  30.56 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  31.62 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  33.04 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  27.83 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  28.7 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  27.35 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  29.66 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  35.19 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  34.29 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  35.4 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  28.04 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  26.85 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  29.91 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  29.09 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  27.83 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  34.48 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  27.36 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  28.3 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  29.63 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  29.46 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  32.14 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  28.3 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  26.5 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  32.97 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>