270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2555 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 
135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  54.68 
 
 
133 aa  152  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 
127 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 
132 aa  100  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  45.97 
 
 
126 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  44.92 
 
 
133 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  42.06 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  41.61 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  43.43 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  41.91 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  41.73 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  41.61 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  41.91 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  41.73 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  35.11 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  42.74 
 
 
131 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  41.23 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  40.17 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 
137 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  38.06 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  38.06 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  35.88 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  39.1 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  41.74 
 
 
143 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 
137 aa  92  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  34.46 
 
 
159 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 
135 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
136 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  42.55 
 
 
138 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  35.04 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  42.74 
 
 
134 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  40.88 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  42.55 
 
 
138 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  42.62 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  42.28 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  52.75 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  41.32 
 
 
163 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  45.69 
 
 
144 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  44.86 
 
 
150 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  36.61 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 
141 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  44.92 
 
 
137 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  44.34 
 
 
139 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  46.6 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 
141 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  42.24 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  39.17 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  42.28 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  36.59 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  46.09 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  40.68 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  38.03 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  43.69 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  34.01 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  36.88 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  35.16 
 
 
126 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3312  large conductance mechanosensitive channel protein  41.82 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  38.18 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  41.44 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  34.21 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  37.84 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  39.81 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  34.07 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>