261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1490 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1490  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 125 aa  245  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.105065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0031  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  60.8 
 
 		 125 aa  158  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.840685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2600  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  56.25 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0035  large conductance mechanosensitive channel protein  51.04 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262039  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3243  large conductance mechanosensitive channel protein  48.48 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0695939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  43.3 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2038  large conductance mechanosensitive channel protein  43.43 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499106 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  43.3 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  41.86 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  39.77 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  39.62 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  41.76 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  41.11 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  40.22 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  43.62 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  42.42 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  43.3 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  35.19 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  38.68 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  37.27 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  37.61 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  39.05 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  39.33 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  39.77 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  41.49 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  38.64 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  34.26 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  38.83 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  38.38 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  43.3 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  30.28 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  34.86 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  35.58 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  37.38 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  30.91 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  34.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  36.63 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02405  large conductance mechanosensitive channel protein  36.54 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.914683  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  35.24 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  34.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  35.42 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  35 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  30.17 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  34.65 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  34.62 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  42.57 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  34.62 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  35.45 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  32.14 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  34 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  34.62 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  33.59 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  38.95 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  35.58 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  30.84 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  35.92 
 
 		 143 aa  57  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  31.82 
 
 		 142 aa  57  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  32.95 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  31.82 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  40.96 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  37.61 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  35.14 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  34.62 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  36.04 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  35.51 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>