270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1991 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 133 aa  260  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  54.81 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  44.85 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  42.65 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  41.48 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  45.67 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  41.73 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02405  large conductance mechanosensitive channel protein  38.46 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.914683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  41.48 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  40.91 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  36 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  41.27 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  40.48 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  40.98 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  42.15 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  40.16 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  38.97 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  43.93 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  39.71 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  39.71 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  38.97 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  40.19 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  38.81 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  37.3 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  37.3 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  39.05 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  37.12 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  37.41 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  38.66 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  42.72 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  37.21 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  45.37 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  36.55 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  42.15 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  37.06 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  37.24 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  35.34 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  37.24 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  37.82 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  38.84 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  35.25 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  36.55 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  36.55 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  38.46 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  36.29 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  37.7 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  36.55 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  36.69 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  36.59 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  36.29 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  41.44 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  35.86 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  37.78 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 199 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  34.97 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  38.28 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  37.01 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  37.84 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  38.58 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  40.8 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  42.39 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  42.39 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  38.24 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  37.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  37.07 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  41.07 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  40.35 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  37.3 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  36.45 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  40.35 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>