242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0031 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0031  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 125 aa  243  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.840685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1490  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  60.8 
 
 		 125 aa  158  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.105065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2600  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  58 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0035  large conductance mechanosensitive channel protein  53 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262039  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3243  large conductance mechanosensitive channel protein  44 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0695939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  43.43 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  47.37 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  41.86 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  46.59 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  43.96 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  37.14 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  41.12 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2038  large conductance mechanosensitive channel protein  38.61 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499106 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  38.38 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  41.49 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  41.11 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  37.37 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  39.18 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  41.11 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  38.39 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  37.04 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  35.45 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  35.45 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  33.98 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  40.22 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  39.13 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  36.67 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  34.44 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  31.25 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  36.11 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  32.46 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  39.77 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  41.11 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  33.05 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  44.19 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  36.67 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  36.67 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  30.51 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  39.8 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  29.73 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  33.01 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  35.58 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  34.02 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  33.01 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  39.13 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  30.36 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02405  large conductance mechanosensitive channel protein  32.38 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.914683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  35.23 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  26.13 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  36.54 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  30.77 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  35 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  32.67 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  30.91 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  36.28 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  30.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  30.77 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  35.79 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  33.01 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  38.89 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  33.7 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  33.01 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  37 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  31.78 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  36.04 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  39.56 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  39.56 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  32.43 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  31.9 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>