131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0183 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0183  multidrug efflux protein  100 
 
 		 384 aa  739    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0826  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 379 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.978591  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1386  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1200  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0259923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0844  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 368 aa  99.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.313239  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0776  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368267  decreased coverage  0.00232333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0418  hypothetical protein  25.26 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00299596 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  33.07 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  33.07 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  33.07 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  33.07 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  33.07 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 466 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  33.59 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  30.71 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 458 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  30.71 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  30.71 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  30.71 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 		 495 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  32.67 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  29.92 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  26.94 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  25.71 
 
 		 458 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  24.62 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0041  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 551 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0040  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.25 
 
 		 540 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.295395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 472 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  33.64 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  31.91 
 
 		 526 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  32.79 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  31.68 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18730  arabinose efflux permease family protein  34.13 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.635364  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  29.63 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.37 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  27.69 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  28.78 
 
 		 467 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  32.97 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 489 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  32.97 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  32.97 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  32.97 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  32.97 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 493 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  30.69 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 484 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>