74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0776 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0776  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
360 aa  704    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368267  decreased coverage  0.00232333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1200  major facilitator transporter  45.94 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0259923  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1386  major facilitator transporter  44.32 
 
 
367 aa  275  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0418  hypothetical protein  37.29 
 
 
363 aa  219  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00299596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0844  major facilitator transporter  36.12 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.313239  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0826  major facilitator transporter  27.57 
 
 
379 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.978591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0183  multidrug efflux protein  25.35 
 
 
384 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931124  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  39.34 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  40.16 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  34.43 
 
 
421 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  30.46 
 
 
469 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
403 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.58 
 
 
397 aa  49.7  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  30.41 
 
 
500 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  24.18 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  26.15 
 
 
498 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  31.54 
 
 
486 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.69 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
430 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5283  major facilitator transporter  31.43 
 
 
515 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280334  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.24 
 
 
411 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0463  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 
366 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.44223  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  28.86 
 
 
405 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.94 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.94 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.93 
 
 
474 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.75 
 
 
480 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  29.91 
 
 
482 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 
406 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  25 
 
 
466 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  25 
 
 
466 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  33.01 
 
 
475 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  33.01 
 
 
475 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
389 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  30.49 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  32.32 
 
 
458 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.43 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
465 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.99 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  28.72 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  32.04 
 
 
475 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  33.75 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
489 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  27.62 
 
 
489 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  25 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  31.25 
 
 
483 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  32.69 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  31.07 
 
 
514 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.19 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  31.25 
 
 
483 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  27.62 
 
 
489 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  25 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  31.79 
 
 
410 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  27.62 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  32.04 
 
 
475 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.54 
 
 
409 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  31.68 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  24.07 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  31.79 
 
 
410 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.92 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
396 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  31.79 
 
 
410 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  26.61 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1278  hypothetical protein  34.18 
 
 
386 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.47 
 
 
412 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
406 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  30.9 
 
 
512 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  24.09 
 
 
475 aa  42.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1277  hypothetical protein  34.18 
 
 
386 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.32 
 
 
398 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  28.21 
 
 
405 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>