92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6031 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6031  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 245 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.492399  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7254  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  83.73 
 
 		 209 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2910  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  68.61 
 
 		 230 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  60.33 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  60.33 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  63.2 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4022  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  55.08 
 
 		 183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000610281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2812  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  59.24 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0629  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  54.79 
 
 		 162 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0377495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1841  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  56.06 
 
 		 165 aa  158  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00146422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4051  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit  55.48 
 
 		 180 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.329633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2528  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  54.78 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2787  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.22 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000522738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3002  TRAP transporter - DctQ subunit  32.37 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5135  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.37 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.621733 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  29.82 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3674  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.07 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1470  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.01 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.14 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1604  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  34.48 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.078531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0258  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.48 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0544  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.71 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.557919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1723  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0475394  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1090  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.95 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0890905  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0271  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.39 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1549  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system small permease component-like protein  34.44 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2934  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.89 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.65832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3446  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  37.42 
 
 		 171 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.82702  normal  0.0799989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2238  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.25 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2033  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.77 
 
 		 732 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105106  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3538  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  29.41 
 
 		 168 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3878  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.27 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0984  TRAP transporter DctM family protein  34.62 
 
 		 631 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4576  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.04 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  29.27 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0033  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.05 
 
 		 187 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3619  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.67 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0697  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.940748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.95 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3518  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0661  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.73 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3901  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.1 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.507253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.41 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.428126  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  25.95 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0606  hypothetical protein  26.04 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6993  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.21 
 
 		 631 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3452  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.91 
 
 		 179 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3654  TRAP transporter DctQ family protein  30.49 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3428  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.85 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0023  permease (transport protein)  26.92 
 
 		 159 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.352968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5944  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.2 
 
 		 171 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0343  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.79 
 
 		 168 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.95 
 
 		 192 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36 
 
 		 156 aa  45.4  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0113  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.32 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1202  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.15 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00964001  normal  0.857795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2930  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.26 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.45 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  22.7 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2136  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  32.97 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1292  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.15 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  29.29 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4095  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  32.63 
 
 		 628 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.29 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1382  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.91 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000585397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1781  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.7 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000929504 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3342  hypothetical protein  29.57 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.554631  normal  0.0946666 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4716  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.53 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.60201  normal  0.0226509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3805  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.32 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.969823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2891  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.93 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1242  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.73 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000810509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3083  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.93 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0835  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.98 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4858  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.28 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4951  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.11 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.61 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2649  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.93 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000630  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  28.68 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0386  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.13 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3132  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.53 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2122  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0479632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1162  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.64 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2479  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.53 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4765  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.53 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010311 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0330  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  26.95 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3868  hypothetical protein  28.47 
 
 		 190 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.71 
 
 		 155 aa  42.4  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5096  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.01 
 
 		 174 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3687  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.79 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3367  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.78 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1148  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.52 
 
 		 196 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>