29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2186 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3538  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  47.76 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2288  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.23 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212485  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0635  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  36.23 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  29.45 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1476  hypothetical protein  30.83 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0587792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.67 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7254  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.95 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.21 
 
 		 241 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4204  hypothetical protein  28.06 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1292  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.31 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2910  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.17 
 
 		 230 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3208  hypothetical protein  32.7 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1025  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.89 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.045195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6031  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.45 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.492399  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.52 
 
 		 241 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0271  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.53 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.52 
 
 		 241 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2942  hypothetical protein  26.67 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000148294  decreased coverage  0.00000918436 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0359  hypothetical protein  29.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.537959  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0444  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.8 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0343  hypothetical protein  29.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0871  hypothetical protein  28.46 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0544539  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.08 
 
 		 172 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1403  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  28.57 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  33.96 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  29.46 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2812  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.35 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>