24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3498 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  346  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  36.18 
 
 		 194 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  36.72 
 
 		 167 aa  94.4  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  39.37 
 
 		 191 aa  94  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  40.12 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  41.91 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  37.69 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  31.33 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  29.37 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  37.12 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  32.67 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.86 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.83 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0710  hypothetical protein  29.2 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.76 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7097  TrapT family, dctQ subunit C4-dicarboxylate transport  30.2 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2260  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  28.57 
 
 		 175 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.077758  normal  0.0497776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4737  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.53 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3518  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.67 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1339  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ subunit, putative  34.65 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3538  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  28.45 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0635  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  29.41 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1964  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  26.06 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242262  normal  0.045468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  30.3 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>