21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1332 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  321  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  42.31 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  37.69 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  31.13 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  38.1 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  39.04 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  31.33 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  35.52 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  29.68 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  32.2 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  29.77 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  46.15 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000630  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  28.1 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2288  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.82 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212485  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0635  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  27.82 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  28.57 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1707  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.43 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0635  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.72 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  31.82 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>