15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2123 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  62.09 
 
 		 160 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  37.12 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  31.41 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  30.5 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  28.86 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  28.29 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  22.67 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  28.89 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  35.37 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2457  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  25.83 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1362  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.26 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.73 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>