20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0283 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  36.18 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  35.4 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  36.26 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  37.67 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  31.82 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  33.12 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  31.33 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  29.56 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  28.26 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  22.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  28.21 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  35.63 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.91 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3265  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.06 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1707  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  28.91 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0513  hypothetical protein  25.67 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  32.84 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3221  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.09 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000218018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  30.68 
 
 		 177 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>