15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3130 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  47.85 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  34.94 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  35.83 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  30.36 
 
 		 167 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  30.23 
 
 		 160 aa  72  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  30.12 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  31.29 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  28.86 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0513  hypothetical protein  29.81 
 
 		 173 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  31.18 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  24.63 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  24.64 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2942  hypothetical protein  27.19 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000148294  decreased coverage  0.00000918436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>