21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1481 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  36.26 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  40.12 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  35.83 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  33.84 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  30.41 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  33.52 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  46.84 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  43.96 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  32.03 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  29.49 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  28.92 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  37.84 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0647  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  26.32 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2056  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  30.28 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0710  hypothetical protein  27.27 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  32.1 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  27.47 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  27.27 
 
 		 145 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3171  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  31.4 
 
 		 173 aa  41.2  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7254  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.81 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>