16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2568 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  309  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  62.09 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  41.91 
 
 		 173 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  33.78 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  39.04 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  31.51 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  32.62 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  33.54 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  29.56 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  28.15 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2457  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.13 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0635  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  33.72 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0635  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  28.12 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2288  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.12 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212485  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0647  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  25.93 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>