15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3673 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  353  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  42.31 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  33.52 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  29.37 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  33.12 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  30.5 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  26.53 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2568  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  30.51 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1470  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.99 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.2 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3518  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.43 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  24.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.37 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>