33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2002 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 162 aa  326  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  41.29 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2056  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  39.34 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  37.5 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2457  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.51 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1707  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  37.29 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0635  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  33.88 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  30.7 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3538  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  26.56 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  26.83 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28441  TRAP-T family tripartite transporter  31.72 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.922538 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  28.91 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0271  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.35 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.95 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3581  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  28.15 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120182  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  25.98 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0513  hypothetical protein  25.56 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3914  TrapT family, DctQ subunit C4-dicarboxylate transport  31.11 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3673  hypothetical protein  23.2 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2490  hypothetical protein  27.48 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7097  TrapT family, dctQ subunit C4-dicarboxylate transport  22.31 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.42 
 
 		 180 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3083  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.59 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.34847  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2293  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.25 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3154  TRAP transporter-DctQ subunit putative  26.05 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3901  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.35 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.507253  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3687  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.36 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1403  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  25.81 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3474  putative TRAP C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit (small permease component)  25.77 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.08 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.428126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  25.71 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1985  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.24 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.399446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.78 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>