18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3089 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3171  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  42.51 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0647  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  37.5 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1339  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ subunit, putative  34.56 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1304  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  42.42 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.678951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3025  hypothetical protein  31.13 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.720662  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0513  hypothetical protein  26.36 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3914  TrapT family, DctQ subunit C4-dicarboxylate transport  31.18 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3130  hypothetical protein  24.63 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  27.54 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4195  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.45 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  32.1 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3154  TRAP transporter-DctQ subunit putative  25.56 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2123  hypothetical protein  34.62 
 
 		 162 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.929904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.71 
 
 		 162 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0709  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  27.34 
 
 		 207 aa  40.8  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  30.68 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>