80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3083 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3083  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.34847  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3619  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.48 
 
 		 198 aa  91.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2934  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.29 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.65832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0697  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.62 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.940748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3805  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.25 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.969823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2033  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.64 
 
 		 732 aa  64.3  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105106  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1382  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000585397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1242  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.74 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000810509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3654  TRAP transporter DctQ family protein  30.14 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2484  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system small permease component-like protein  28.86 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0291342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1470  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.68 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1376  hypothetical protein  32.56 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1549  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system small permease component-like protein  31.13 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4951  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.19 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3149  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.07 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0190342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2207  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.15 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3371  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  28.07 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3247  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.83 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178122  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1403  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  32.5 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0893  hypothetical protein  32.56 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000529967  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3868  hypothetical protein  29.31 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3017  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.07 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1797  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ (4TM)subunit  30.34 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107972  hitchhiker  0.000251501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4869  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.59 
 
 		 159 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120214  normal  0.368894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1812  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.58 
 
 		 225 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.133229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.17 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3132  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.4 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2479  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.4 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3901  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.89 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.507253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3213  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.23 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6993  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.12 
 
 		 631 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0208  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.09 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3751  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.46 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2444  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.52 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4195  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.24 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293358  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.29 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1090  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.48 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0890905  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0129  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component (dctQ subunit)  23.39 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0130  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  29.55 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1202  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.53 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00964001  normal  0.857795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0571  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  25 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3328  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.77 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.71 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.59 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0033  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.29 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0345  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.63 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2568  TRAP transporter, transmembrane protein, putative  29.5 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2410  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.51 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.932493  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1622  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  32.89 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3878  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.35 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3478  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.04 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0672  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.43 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7435  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.37 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7254  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.93 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.29 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0113  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.45 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2930  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  21.82 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3117  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.91 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.573948  hitchhiker  0.000638451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2293  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.94 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2923  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.11 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.640281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3945  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.83 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6027  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.47 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0227633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5662  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.47 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.652959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4765  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.36 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0485  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  28.46 
 
 		 181 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.598438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0709  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  22.14 
 
 		 207 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3271  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  30.43 
 
 		 619 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373435  normal  0.294977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0539  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  22.14 
 
 		 207 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6354  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.15 
 
 		 623 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.522934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5980  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.2 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223945  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.29 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5135  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.73 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.621733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6517  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.47 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2741  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  29.21 
 
 		 626 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359375  normal  0.0328397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1538  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  30 
 
 		 623 aa  41.2  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0479957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2137  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.46 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103028  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2593  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.82 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480245  normal  0.0803761 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3342  hypothetical protein  30.84 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.554631  normal  0.0946666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003133  TRAP dicarboxylate transporter DctQ subunit  31.4 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00512706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3364  hypothetical protein  24.04 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>