21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0330 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0330  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  100 
 
 		 163 aa  327  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000018584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  41.29 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2056  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  34.75 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.69 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0635  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  32.31 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2457  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  31.65 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  29.85 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1332  hypothetical protein  45.45 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  37.84 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  31.76 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3083  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.71 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.34847  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1549  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system small permease component-like protein  27.44 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  25.34 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3744  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.12 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0283  hypothetical protein  32.84 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1985  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.07 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.399446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.65 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28 
 
 		 155 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5035  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  32.88 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  25.32 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5331  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.78 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>