19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7097 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7097  TrapT family, dctQ subunit C4-dicarboxylate transport  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3581  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  72.56 
 
 		 189 aa  248  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120182  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3914  TrapT family, DctQ subunit C4-dicarboxylate transport  72.22 
 
 		 174 aa  245  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1985  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  66.46 
 
 		 190 aa  229  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.399446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.96 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4195  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.09 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3654  TRAP transporter DctQ family protein  22.29 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.91 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3498  hypothetical protein  30.2 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0213858  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1524  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.79 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0215474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2002  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.31 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0151036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  23.33 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2293  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0646  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.19 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3154  TRAP transporter-DctQ subunit putative  26.72 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4501  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.78 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.832526  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  24.67 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0045  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6993  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.15 
 
 		 631 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>