67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1025 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1025  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 
185 aa  358  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.045195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.96 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.67 
 
 
172 aa  91.3  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  33.54 
 
 
169 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  36.02 
 
 
168 aa  84.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  32.72 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1778  hypothetical protein  29.94 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2484  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.12 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.01974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1376  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  33.12 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3298  hypothetical protein  31.68 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.684263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.74 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2910  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.14 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1875  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  28.97 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00459438  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.88 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1773  hypothetical protein  31.85 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.57 
 
 
241 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2338  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.62 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2812  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.37 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  27.18 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7254  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.82 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4929  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  29.22 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.371415  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  24.46 
 
 
199 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02559  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.16 
 
 
241 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.16 
 
 
241 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0492  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.87 
 
 
634 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.189133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4051  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit  30.69 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.329633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4022  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.58 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000610281  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1274  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  27.81 
 
 
635 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0864144  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.75 
 
 
206 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2528  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.58 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  26.75 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3265  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.67 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1841  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.42 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00146422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3714  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.49 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000556878  n/a   
 
 
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  28.68 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0606  hypothetical protein  28.77 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  28.7 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1090  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.57 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0890905  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0357  hypothetical protein  23.28 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0895709  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0557  hypothetical protein  19.82 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3674  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.5 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1470  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.83 
 
 
187 aa  44.7  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355581  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3372  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.47 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0271  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.05 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2787  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.16 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000522738  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6031  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.47 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.492399  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2238  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0610  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809519  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3428  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.52 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21898  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0672  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.06 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0446  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.91 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000156898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5035  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.47 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1162  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.83 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3674  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.42 
 
 
179 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2122  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0479632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0453  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.57 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0983838  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2258  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.27 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1556  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.06 
 
 
198 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0544  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.19 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.557919  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0113  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.61 
 
 
219 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0417  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29 
 
 
185 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000370406  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3654  TRAP transporter DctQ family protein  27.05 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1504  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 
199 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.09 
 
 
180 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1202  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.71 
 
 
183 aa  41.2  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00964001  normal  0.857795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0959  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.16 
 
 
208 aa  40.8  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>