39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0524 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 172 aa  340  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2484  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  52.33 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.01974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1376  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  52.33 
 
 		 169 aa  165  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  48.84 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1773  hypothetical protein  51.16 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2338  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  51.55 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  44.16 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1778  hypothetical protein  40.51 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  46.75 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.01 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  42.11 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0357  hypothetical protein  36.17 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0895709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3298  hypothetical protein  40.88 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1025  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.67 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.045195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1875  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  32.48 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00459438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  30.87 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  33.94 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.87 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3714  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.82 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000556878  n/a   
 
 
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.68 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0499  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.77 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.701634  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  33.64 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  26.32 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0113  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0557  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4929  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  31.43 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.371415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3428  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.22 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3154  TRAP transporter-DctQ subunit putative  28.03 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1734  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0330  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  27.03 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3002  TRAP transporter - DctQ subunit  27.03 
 
 		 183 aa  44.3  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0661  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.34 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2568  TRAP transporter, transmembrane protein, putative  29.01 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3538  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  27.97 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2450  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.43 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.561337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0513  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0606  hypothetical protein  29.69 
 
 		 188 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.21 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455407  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>