40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0557 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0113  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  69.79 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  39.66 
 
 		 199 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1734  hypothetical protein  36.15 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0606  hypothetical protein  32.97 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2568  TRAP transporter, transmembrane protein, putative  29.88 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3154  TRAP transporter-DctQ subunit putative  29.19 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  27.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0959  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.41 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2045  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.48 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.366338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1041  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.88 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0743648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1574  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.72 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 172 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1504  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.75 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.62 
 
 		 168 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.08 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.21 
 
 		 159 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0499  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.32 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.701634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.88 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2601  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.27 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2246  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.74 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.53 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2871  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.27 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02559  hypothetical protein  25.17 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2457  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  23.48 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.57 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.32 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3428  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.23 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0444  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.53 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4360  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.54 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0343  hypothetical protein  24.26 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0359  hypothetical protein  24.26 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.537959  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0190  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.41 
 
 		 176 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2034  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.47 
 
 		 179 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00133922  normal  0.0453092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34 
 
 		 178 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1403  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  25.66 
 
 		 174 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1162  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.19 
 
 		 147 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>