27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1875 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1875  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  100 
 
 		 183 aa  362  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00459438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1778  hypothetical protein  41.38 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3298  hypothetical protein  40.34 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684263 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.88 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1376  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.46 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2484  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.46 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.01974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.48 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.7 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.55 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2338  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.93 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.16 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.86 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1773  hypothetical protein  32.65 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1025  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.97 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.045195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0357  hypothetical protein  27.07 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0895709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.88 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2910  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.65 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  27.27 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  26.92 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.34 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.5 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.34 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0606  hypothetical protein  29.46 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4929  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  33.7 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.371415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  28 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3714  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.94 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000556878  n/a   
 
 
 
NC_011894  Mnod_7254  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.34 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>