30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3298 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3298  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  350  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.684263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1778  hypothetical protein  70.62 
 
 
200 aa  265  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1875  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  40.34 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00459438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  40.88 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.78 
 
 
188 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1376  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.46 
 
 
169 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2484  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.46 
 
 
169 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.01974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.84 
 
 
169 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.78 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.72 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2338  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.71 
 
 
169 aa  94.4  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1025  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.68 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.045195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  33.33 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3714  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.33 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000556878  n/a   
 
 
 
NC_007948  Bpro_1773  hypothetical protein  34.84 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0357  hypothetical protein  26.6 
 
 
204 aa  64.3  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0895709  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  31.53 
 
 
206 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.63 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3428  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.63 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21898  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.37 
 
 
241 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  19.75 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2148  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.73 
 
 
176 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0446  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.68 
 
 
187 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000156898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2910  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.37 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  22.82 
 
 
182 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4121  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.89 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2045  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.43 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.366338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  21.74 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3265  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.58 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7254  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.67 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>