205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4997 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4997  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 619 aa  1283    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  25.06 
 
 		 487 aa  137  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 520 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 533 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  22.96 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  21.95 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 488 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.13 
 
 		 441 aa  91.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 441 aa  91.3  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 556 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  22.59 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.59 
 
 		 609 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 608 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.27 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  29.39 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.09 
 
 		 472 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  26.47 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  21.78 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  24.16 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  21.66 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  22.42 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  23.79 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 609 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  21.35 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  22.42 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  21.32 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  22.17 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  20.73 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 555 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  22.66 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  21.95 
 
 		 528 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 424 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  28.57 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  21.18 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.19 
 
 		 612 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 603 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  22.56 
 
 		 864 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  21.89 
 
 		 618 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0204  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.86 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  21.29 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.76 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.36 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  27.41 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.79 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  21.45 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0906  cobalamin B12-binding domain protein  28.64 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4370  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 501 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  24.06 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.19 
 
 		 681 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  24.06 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2166  radical SAM family Fe-S protein  22.98 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  22.44 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  22.46 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 581 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  21.45 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0247  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2203  cobalamin B12-binding domain protein  23.79 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28.77 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  28.57 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 559 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.98 
 
 		 485 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  21.36 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  19.67 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2167  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298857  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  25.43 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.5 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>