100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2473 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  82.27 
 
 		 285 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3109  hypothetical protein  71.16 
 
 		 285 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2795  hypothetical protein  68.34 
 
 		 286 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  66.17 
 
 		 277 aa  358  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  68.18 
 
 		 288 aa  341  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  52.03 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  51.15 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  50.97 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  50.38 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  53.17 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  52.14 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40950  predicted protein  48.34 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  53.28 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  50.61 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2182  hypothetical protein  51.26 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45364  predicted protein  49.79 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0471946 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  45.75 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  35.05 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  33.16 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  32.63 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  32.63 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  30.95 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  32.19 
 
 		 211 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  29.82 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  27.72 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  31.41 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  31.94 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  30.37 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  31.94 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  29.21 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  29.44 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  31.41 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  28.42 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.47 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  29.63 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  26.79 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  29.79 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  29.79 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  29.26 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  29.1 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  31.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  29.59 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  27.36 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  29.84 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  32.75 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  32.75 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  32.75 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  30.16 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  29.47 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  29.32 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  29.84 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  27.6 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  29.28 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  28.89 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.76 
 
 		 781 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  27.98 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  28.11 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  27.98 
 
 		 218 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  27.98 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  29.28 
 
 		 217 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  28.64 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  27.23 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.31 
 
 		 789 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  29.9 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  28.65 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  29.31 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  28.33 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.22 
 
 		 761 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  28.65 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  31.05 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  31.05 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  23.04 
 
 		 197 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  25.65 
 
 		 204 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  27.62 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.23 
 
 		 789 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  28.8 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  27.59 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.06 
 
 		 790 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.56 
 
 		 752 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  27.59 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  24.61 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  26.42 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.77 
 
 		 789 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.65 
 
 		 772 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  27.27 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  27.98 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  25.56 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  24.02 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  28.27 
 
 		 757 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  25.39 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  28.87 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  27.97 
 
 		 179 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>