153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3727 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  81.34 
 
 		 224 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  65.28 
 
 		 214 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  65.28 
 
 		 214 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  65.28 
 
 		 214 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  65.52 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  66.15 
 
 		 202 aa  276  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  60.98 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  64.82 
 
 		 208 aa  267  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  58.64 
 
 		 199 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  61.5 
 
 		 211 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  52.53 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  53.33 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  50.95 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  53.23 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  49.04 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  49.51 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  53.5 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  47.55 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  53.89 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  53.89 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  54.3 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  49.74 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  50.25 
 
 		 211 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  49.27 
 
 		 215 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  49.74 
 
 		 216 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  49 
 
 		 212 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  50.27 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  49.73 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  49.47 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  49.47 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  46.73 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  44.19 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  48.91 
 
 		 212 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  51.38 
 
 		 211 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  48.65 
 
 		 205 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  47.52 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  47.42 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  49.2 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  47.59 
 
 		 212 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  48.17 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  50.28 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  49.72 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  44.93 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  47.37 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  47.37 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  47.37 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  43.54 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  44.66 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  32.14 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  32.51 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  33.86 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  33.81 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  36.99 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  35.93 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  35.64 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  31.68 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  32.66 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  34.6 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  34.92 
 
 		 204 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  30.57 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  31.86 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  33.8 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  28.05 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  33.8 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  29.31 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  34 
 
 		 277 aa  91.7  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  29.72 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  26.84 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  28.5 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  27.83 
 
 		 279 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  31.19 
 
 		 287 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  28.84 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  29.72 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  30.96 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  26.4 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  29.31 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  28.07 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  32.93 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  28.32 
 
 		 268 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  29.08 
 
 		 195 aa  85.5  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  29.02 
 
 		 198 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  26.84 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  30.96 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  30.96 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  26.98 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  27.81 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  27.96 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 781 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  26.6 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  31.03 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>