141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2500 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  70.48 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  71.22 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  58.74 
 
 		 270 aa  328  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  60.31 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  57.62 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  57.78 
 
 		 270 aa  318  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  54.75 
 
 		 277 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  51.89 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  52.65 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  47.13 
 
 		 270 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  46.49 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  42.36 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  43.08 
 
 		 260 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  41.7 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  42.6 
 
 		 235 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  42.04 
 
 		 242 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  40.35 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  41.7 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  38.75 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  41.7 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  38.33 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  38.57 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  40.81 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  38.57 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  37.34 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  36.93 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  35.81 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  38.79 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  36.44 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  33.19 
 
 		 245 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  37.89 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  37.89 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  37.3 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  36.73 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  36.73 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  36.44 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  33.77 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  31.73 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  35.15 
 
 		 215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  35.37 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  34.05 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  35.24 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  34.21 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  34.21 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  32.52 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  35.2 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  35.94 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  35.32 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  32.35 
 
 		 216 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  34.27 
 
 		 218 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.98 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  33.8 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  35.57 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  35.57 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  35.38 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  34.04 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  34.97 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  35.9 
 
 		 205 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  32.69 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  34.83 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  35.57 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  32.29 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  30.69 
 
 		 216 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  31.42 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  34.76 
 
 		 218 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  34.54 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  33.5 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  34.04 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  32.04 
 
 		 216 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  30.93 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  35.64 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  30.73 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  31.77 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  31.82 
 
 		 211 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  29.17 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  31.03 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  31.09 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  31.52 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  30.69 
 
 		 212 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  31.25 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  36.6 
 
 		 179 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  30.3 
 
 		 214 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  30.3 
 
 		 214 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  30.3 
 
 		 214 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  30.85 
 
 		 217 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  30.85 
 
 		 235 aa  95.9  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.72 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.89 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  30.73 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  31.49 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  26.8 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  30.56 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>