112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3667 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  60.35 
 
 		 307 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  60.35 
 
 		 307 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  59.65 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  54.38 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  54.51 
 
 		 287 aa  271  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  56.33 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  50 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  46.96 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  40.98 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  35.09 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  39.7 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  39.32 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  34.69 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  39.2 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  40.91 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  39.9 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  38.46 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  36.87 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  36.36 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  37.57 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  37.57 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  37.57 
 
 		 251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  33.76 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  34.58 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  36.96 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  33.49 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  33.99 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  30.73 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  32.49 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  31.91 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  34.33 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  32.2 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  29.19 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.76 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  30.05 
 
 		 216 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  30.6 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  30.65 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  30.05 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  31.03 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  31.62 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  32.16 
 
 		 214 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  30.05 
 
 		 216 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  32 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  32.75 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  32.75 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  31.75 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.95 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  32.61 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  29.79 
 
 		 214 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  33.15 
 
 		 241 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  28.72 
 
 		 211 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  29.44 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  28.22 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  30.71 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  27.66 
 
 		 212 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  29.03 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  27.72 
 
 		 217 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  27.56 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  28.11 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  26.57 
 
 		 214 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  31.88 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  26.84 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  27.98 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  28.42 
 
 		 218 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  27.17 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  26.64 
 
 		 245 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  27.85 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  30.41 
 
 		 205 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  26.78 
 
 		 211 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  26.88 
 
 		 211 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  26.84 
 
 		 218 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  26.84 
 
 		 218 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  30.94 
 
 		 244 aa  85.9  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  25.95 
 
 		 213 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  26.88 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  26.32 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  25.79 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  26.88 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  29.24 
 
 		 205 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  26.11 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  27.63 
 
 		 179 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  28.88 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  25.13 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  28.82 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  29.02 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  27.53 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  29.65 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  27.96 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  27.96 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  27.96 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  27.17 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  25.14 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  25.85 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  26.51 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  23.37 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>