123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1382 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  93.23 
 
 
251 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  76.8 
 
 
251 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  76.8 
 
 
251 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  76.4 
 
 
251 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  60.92 
 
 
244 aa  293  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  58.97 
 
 
244 aa  284  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  53.23 
 
 
257 aa  264  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  53.62 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  49.58 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  52.36 
 
 
241 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  50 
 
 
245 aa  235  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  51.28 
 
 
235 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  48.7 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  48.5 
 
 
268 aa  225  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  48.5 
 
 
241 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  48.94 
 
 
242 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  48.5 
 
 
241 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  46.58 
 
 
248 aa  218  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  47.08 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  46.81 
 
 
239 aa  211  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  44.87 
 
 
248 aa  208  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  46.09 
 
 
245 aa  208  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  40.68 
 
 
243 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  43.17 
 
 
244 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  39.91 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  41.32 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  41.74 
 
 
273 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  40.25 
 
 
274 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  41.74 
 
 
273 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  38.46 
 
 
215 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  40.09 
 
 
269 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  38.4 
 
 
270 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  39.18 
 
 
270 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  39.92 
 
 
277 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  37.76 
 
 
270 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  39.22 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  35.32 
 
 
214 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  37.89 
 
 
275 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  38.81 
 
 
211 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  34.95 
 
 
232 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  37.7 
 
 
280 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  35.82 
 
 
214 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  35.8 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  34.85 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  34.85 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  35.85 
 
 
218 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  36.75 
 
 
274 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  34.43 
 
 
218 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  36.54 
 
 
218 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  36.54 
 
 
218 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  34.01 
 
 
216 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  37.75 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  31.37 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  34.15 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  37.02 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  37.32 
 
 
223 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  32.49 
 
 
216 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  33.5 
 
 
216 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  38.53 
 
 
260 aa  131  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  32.68 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  34.29 
 
 
212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  36.77 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  35.64 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  33.94 
 
 
213 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  34.18 
 
 
307 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  34.18 
 
 
307 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  33.17 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  31.86 
 
 
211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  36.18 
 
 
211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  35.68 
 
 
211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  35.82 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  33.76 
 
 
307 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  37 
 
 
229 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  34.31 
 
 
211 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  32.8 
 
 
287 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  35.53 
 
 
202 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  35.89 
 
 
283 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  36.4 
 
 
281 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  34.7 
 
 
214 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  34.7 
 
 
214 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  37.13 
 
 
235 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  34.7 
 
 
214 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  34.12 
 
 
208 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  34.83 
 
 
211 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  32.51 
 
 
205 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  36.95 
 
 
219 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  31.9 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  34.67 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  32.49 
 
 
300 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  35.68 
 
 
277 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  33 
 
 
205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  31.98 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  35.42 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  33.86 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  34.04 
 
 
199 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  34.39 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  35.58 
 
 
179 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  27.84 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>