156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2501 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  81.86 
 
 		 216 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  81.86 
 
 		 216 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  74.42 
 
 		 216 aa  345  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  73.89 
 
 		 214 aa  330  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  74.62 
 
 		 206 aa  327  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  74.62 
 
 		 206 aa  327  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  69.85 
 
 		 214 aa  315  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  69.7 
 
 		 211 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  69.43 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  68.18 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  64.42 
 
 		 211 aa  304  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  63.24 
 
 		 210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  59.26 
 
 		 215 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  57.21 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  55.56 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  57.71 
 
 		 211 aa  251  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  58.38 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  55.88 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  56.1 
 
 		 212 aa  244  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  53.62 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  53.77 
 
 		 202 aa  244  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  53.62 
 
 		 218 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  59.39 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  52.91 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  50.23 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  54.9 
 
 		 213 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  54.46 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  51.67 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  51.67 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  51.67 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  55.78 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  54.15 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  52.88 
 
 		 216 aa  234  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  53.27 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  50.25 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  54.59 
 
 		 205 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  52.2 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  52.48 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  54.89 
 
 		 199 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  48.5 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  55.68 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  47.39 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  47.39 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  47.39 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  50.95 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  44.55 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  33.18 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  34.43 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  37.85 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  34.16 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  35.29 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  35.75 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  33.17 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  35.16 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  33.16 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  33.52 
 
 		 269 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  34.62 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  35.03 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  33.84 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 270 aa  121  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  32.65 
 
 		 280 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  33.51 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  32.47 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  33 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  32.35 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  35.2 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  29.82 
 
 		 248 aa  117  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  35.16 
 
 		 273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.09 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  28.71 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  28.71 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  28.71 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  28.44 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  30.53 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  30.2 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  27.15 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  30.93 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  33.85 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  34.21 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  32.45 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  31.05 
 
 		 287 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  27.89 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  30.05 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  31.91 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  31.48 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  26.48 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  29.5 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  27.37 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  30.17 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  28.49 
 
 		 283 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  32.95 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  28.86 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.65 
 
 		 781 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  32.32 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>