123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0941 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  57.92 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  59.74 
 
 
244 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  54.04 
 
 
251 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  53.62 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  49.79 
 
 
257 aa  256  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  52.67 
 
 
251 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  52.67 
 
 
251 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  51.85 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  51.71 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  51.95 
 
 
235 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  50.65 
 
 
242 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  48.91 
 
 
248 aa  230  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  48.03 
 
 
241 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  47.6 
 
 
241 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  46.72 
 
 
241 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  47.9 
 
 
257 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  47.16 
 
 
248 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  46.49 
 
 
239 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  48.2 
 
 
245 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  45.61 
 
 
245 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  43.04 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  41.35 
 
 
276 aa  191  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  34.75 
 
 
243 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  37.23 
 
 
270 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  35.34 
 
 
244 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  35.17 
 
 
278 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  39.91 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  35.54 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  35.65 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  37.55 
 
 
280 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  38.1 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  34.35 
 
 
273 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  36.64 
 
 
274 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  35.85 
 
 
269 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  36.41 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  36.89 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  35.81 
 
 
274 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  32.71 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  33.81 
 
 
270 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  35.82 
 
 
215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  35.24 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  36.1 
 
 
283 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  31.19 
 
 
214 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  34.76 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  32.22 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  33.83 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  31.86 
 
 
212 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  33.5 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  33 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  31.37 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  32.5 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  30.54 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  32.02 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  30.69 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  31.16 
 
 
206 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  32.35 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  31.16 
 
 
206 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  31.19 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  30.85 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  32.21 
 
 
211 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  33.66 
 
 
307 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  33.66 
 
 
307 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  32.37 
 
 
213 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  33.65 
 
 
217 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.91 
 
 
277 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.54 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  34.52 
 
 
219 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  33 
 
 
307 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  31.53 
 
 
212 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  34.15 
 
 
229 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  32.35 
 
 
218 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  32.35 
 
 
218 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  33.16 
 
 
218 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  29.33 
 
 
281 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  33.85 
 
 
235 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  33 
 
 
211 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  31.25 
 
 
205 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  30.6 
 
 
300 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  31.47 
 
 
202 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  30.81 
 
 
211 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  31.34 
 
 
211 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  32.82 
 
 
199 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  34.78 
 
 
260 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  30.93 
 
 
211 aa  98.6  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  31.1 
 
 
205 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  29.76 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  30.32 
 
 
208 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  29.59 
 
 
212 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  28.08 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  28.08 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  28.08 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  29.56 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  28.5 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  27.92 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  32.24 
 
 
179 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  29.51 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  26.92 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>