156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3088 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 		 215 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  73.33 
 
 		 216 aa  332  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  70.7 
 
 		 218 aa  318  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  70.7 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  70.05 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  70.67 
 
 		 212 aa  314  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  68.84 
 
 		 218 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  69.77 
 
 		 218 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  68.84 
 
 		 218 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  68.84 
 
 		 218 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  67.29 
 
 		 213 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  67.62 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  67.62 
 
 		 211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  67.61 
 
 		 214 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  67.65 
 
 		 214 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  67.14 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  67.15 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  66.83 
 
 		 229 aa  298  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  64.79 
 
 		 235 aa  298  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  63.94 
 
 		 219 aa  292  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  65.52 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  67.19 
 
 		 212 aa  284  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  63.41 
 
 		 211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  67.01 
 
 		 205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  60.09 
 
 		 216 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  60.19 
 
 		 211 aa  279  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  59.26 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  66.49 
 
 		 205 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  58.54 
 
 		 214 aa  272  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  60.2 
 
 		 216 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  60.89 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  59.9 
 
 		 206 aa  268  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  59.9 
 
 		 206 aa  268  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  59.7 
 
 		 216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  72.15 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  60.09 
 
 		 210 aa  258  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  257  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  55.88 
 
 		 211 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  56.16 
 
 		 211 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  58.38 
 
 		 208 aa  241  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  60.31 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  57.21 
 
 		 202 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  59.36 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  52.53 
 
 		 221 aa  227  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  53.77 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  52.76 
 
 		 214 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  52.76 
 
 		 214 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  52.76 
 
 		 214 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  49.27 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  47.8 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  40.28 
 
 		 243 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  38.46 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  39.42 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  39.71 
 
 		 278 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  39.13 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  38.24 
 
 		 270 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  37.37 
 
 		 280 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  38.12 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  36.19 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  37.75 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  36.32 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  35.58 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  35.58 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  35.61 
 
 		 274 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  35.1 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  33.65 
 
 		 279 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  35.38 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  35.15 
 
 		 275 aa  128  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  34.13 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  33.82 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  35.82 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  34.26 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  34.48 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  35.23 
 
 		 273 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  33.82 
 
 		 270 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  34.72 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.82 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  34.8 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  30.95 
 
 		 257 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  33.5 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  30.95 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  30.5 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  31.6 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  31.19 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  36.27 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  36.27 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  36.27 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  29.61 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  36.41 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  36.41 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  30.6 
 
 		 300 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  32.34 
 
 		 248 aa  104  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  29.13 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  29.13 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  32.84 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>