142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2396 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  100 
 
 		 248 aa  520  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  92.34 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  74.68 
 
 		 242 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  70 
 
 		 241 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  69.17 
 
 		 241 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  70.69 
 
 		 241 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  67.83 
 
 		 235 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  53.71 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  47.16 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  49.12 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  47.39 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  48.91 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  46 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  48.68 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  46.58 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  44.74 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  45.49 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  45.49 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  45.49 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  43.48 
 
 		 268 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  44.74 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  42.29 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  42.36 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  41.96 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  41.52 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  42.22 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  38.43 
 
 		 243 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  37.99 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  38.57 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  38.57 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  36.86 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  36.86 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  38.43 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  36.4 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  36.68 
 
 		 280 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  38.7 
 
 		 278 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  35.84 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  37.12 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  37.39 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  29.82 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  32.03 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.98 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  30.33 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  33.17 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  32.6 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  30.43 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  30.43 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  31.19 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  30.62 
 
 		 214 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  31.75 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  31.28 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  29.76 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  34.87 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  34.87 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  32.33 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  34.34 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  27.56 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  34 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  36.08 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  32.26 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.73 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  33.86 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  31.63 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  32.41 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  29.03 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  34.36 
 
 		 307 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  31.48 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  32.47 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  33.51 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  32 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  33.51 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  33.51 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  32.5 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  29.44 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  33.86 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  33.19 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  28.84 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  32.51 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  31.5 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  29.44 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  32.99 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  29.77 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  32.12 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  29.22 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  29.22 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  34.43 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  29.22 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  33.16 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  32.26 
 
 		 205 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  31.66 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  30.69 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  29.95 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  29.95 
 
 		 212 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  28.64 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  24.89 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  26.9 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  28.36 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  28.5 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  31.77 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>