155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1791 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  67.14 
 
 
218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  65.73 
 
 
218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  64.49 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  64.49 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  64.49 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  67.61 
 
 
215 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  64.73 
 
 
211 aa  294  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  63.46 
 
 
229 aa  288  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  62.32 
 
 
214 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  65.87 
 
 
232 aa  284  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  62.38 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  65.98 
 
 
212 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  61.88 
 
 
211 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  61.88 
 
 
211 aa  278  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  58.69 
 
 
217 aa  276  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  58.22 
 
 
211 aa  276  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  64.29 
 
 
205 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  61.76 
 
 
216 aa  274  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  63.27 
 
 
205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  58.57 
 
 
219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  60.7 
 
 
212 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  56.81 
 
 
235 aa  261  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  59.7 
 
 
217 aa  254  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  57.92 
 
 
208 aa  241  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  54.55 
 
 
214 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  56.52 
 
 
211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  56.25 
 
 
211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  57.14 
 
 
210 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  57.71 
 
 
202 aa  232  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  53.14 
 
 
216 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  54.95 
 
 
211 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  52.48 
 
 
216 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  53.43 
 
 
221 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  48.6 
 
 
212 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  49.76 
 
 
211 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  63.58 
 
 
179 aa  220  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  50.98 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  54.46 
 
 
223 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  49.06 
 
 
216 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  53.93 
 
 
199 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  48.58 
 
 
216 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  49.03 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  49.03 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  48.31 
 
 
211 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  51.72 
 
 
214 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  51.72 
 
 
214 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  51.72 
 
 
214 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  47.52 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  47.52 
 
 
238 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  33.17 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  36.54 
 
 
207 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  33.94 
 
 
244 aa  134  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  35.1 
 
 
277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  32.06 
 
 
270 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  32.86 
 
 
278 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  32.54 
 
 
270 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  31.9 
 
 
251 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  31.98 
 
 
251 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  31.58 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  31.6 
 
 
279 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  31.02 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  31.6 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  32.41 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  31.86 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  30.19 
 
 
274 aa  111  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  30.48 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  30.33 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  36.32 
 
 
204 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  31.63 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  35.1 
 
 
237 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  35.1 
 
 
237 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  35.1 
 
 
237 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  30.73 
 
 
275 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  29.38 
 
 
280 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  31.71 
 
 
242 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  31.12 
 
 
273 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  32.41 
 
 
248 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  29.05 
 
 
251 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  29.05 
 
 
251 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  29.52 
 
 
276 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  28.24 
 
 
268 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  26.39 
 
 
257 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  32.99 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  32.49 
 
 
204 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  29.76 
 
 
243 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  30.56 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  30.43 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  29.13 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  26.57 
 
 
300 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  28.71 
 
 
241 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  29.52 
 
 
245 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  35.6 
 
 
204 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  28.1 
 
 
280 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  26.32 
 
 
307 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>