138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3746 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  98.53 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  50.79 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  50.56 
 
 		 204 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  40.72 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  39.18 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  41.67 
 
 		 222 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  40.31 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  40.31 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  40.31 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  38.58 
 
 		 238 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  38.58 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  38.58 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  37.82 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  36.65 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  35.68 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  36.18 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  38.51 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  37.57 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  34.52 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  37.93 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  35.86 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  38.31 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  36.14 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  36.41 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  34.9 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  36.52 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  34.04 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  34.88 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  35.94 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  33 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  36.78 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  37.3 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  36.53 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  34.9 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  36.9 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  36.84 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  33 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  34.76 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  37.29 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  34.02 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  34.02 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  34.88 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  36.87 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  34.9 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  34.88 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  33.51 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  33.8 
 
 		 238 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  36.81 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  34.38 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.01 
 
 		 789 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  34.55 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  36.26 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  36.26 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  31 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  33.85 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  91.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  35.33 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  35.68 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.25 
 
 		 772 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  34.69 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  35.64 
 
 		 757 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 		 781 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  34.76 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  31.16 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  27.98 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  31.76 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  36.07 
 
 		 217 aa  87.8  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  32.47 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.18 
 
 		 752 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  35.03 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.16 
 
 		 789 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.67 
 
 		 761 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  34.04 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  34.78 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  28.9 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.11 
 
 		 789 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2656  hypothetical protein  30.59 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  32.45 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  35.98 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.19 
 
 		 790 aa  81.3  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  34.09 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  34.09 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  34.09 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  31.28 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  30.16 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  29.44 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  29.9 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  28.65 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  30.29 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  29.27 
 
 		 286 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  31.64 
 
 		 277 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  27.96 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>