125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1314 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  79.72 
 
 
286 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  79.29 
 
 
286 aa  487  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  79.36 
 
 
286 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  71.17 
 
 
283 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  71.79 
 
 
278 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  69.1 
 
 
310 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  70.46 
 
 
283 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45364  predicted protein  62.68 
 
 
300 aa  331  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0471946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2182  hypothetical protein  59.21 
 
 
299 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230731  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  53.26 
 
 
312 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3109  hypothetical protein  51.54 
 
 
285 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  53.25 
 
 
285 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  49.8 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40950  predicted protein  49.24 
 
 
312 aa  225  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  54.01 
 
 
289 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2795  hypothetical protein  48.45 
 
 
286 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  46.96 
 
 
288 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  29.9 
 
 
207 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  34.04 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  30.89 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.11 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2797  hypothetical protein  57.14 
 
 
56 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000398858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  31.84 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  29.32 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  29.85 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  31.11 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  30.09 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  30.09 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  30.09 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  28.49 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  28.79 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.08 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  26.73 
 
 
210 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  28.28 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  29.68 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  30.6 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  29.09 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  27.78 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  29.19 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  28.27 
 
 
211 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  27.17 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  25.4 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  27.07 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  27.03 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  27.03 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  26.61 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  25.55 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  29.9 
 
 
216 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  30.39 
 
 
204 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  30.98 
 
 
206 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  27.72 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  28.65 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  29.9 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  26.63 
 
 
216 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  24.24 
 
 
197 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  26.96 
 
 
222 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  28.89 
 
 
198 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  25.59 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  28.33 
 
 
232 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  28.11 
 
 
198 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  26.19 
 
 
224 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  28.65 
 
 
219 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  27.92 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  25.96 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  27.14 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  23.98 
 
 
193 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  26.85 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  23.08 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  27.59 
 
 
212 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  26.64 
 
 
238 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.36 
 
 
789 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  28.73 
 
 
238 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  27.47 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  23.87 
 
 
214 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  27.55 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  26.03 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  25.67 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  29.94 
 
 
229 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  28.06 
 
 
218 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  28.06 
 
 
218 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  27.47 
 
 
217 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  29.85 
 
 
211 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  27.55 
 
 
218 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  23.08 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  26.42 
 
 
211 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.24 
 
 
789 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  26.9 
 
 
218 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  25.11 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  25.7 
 
 
244 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.27 
 
 
789 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  24.63 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  27.17 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  29.67 
 
 
206 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  28.42 
 
 
223 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  26.05 
 
 
199 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  25.6 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>