115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2182 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2182  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230731  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  61.51 
 
 
286 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  60.79 
 
 
286 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  60.07 
 
 
286 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  59.21 
 
 
302 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  59.85 
 
 
283 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  56.93 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  57.41 
 
 
283 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  56.67 
 
 
310 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45364  predicted protein  52.1 
 
 
300 aa  280  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0471946 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  47.67 
 
 
312 aa  263  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  50.21 
 
 
285 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3109  hypothetical protein  48.32 
 
 
285 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40950  predicted protein  45.69 
 
 
312 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  48.73 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  52.25 
 
 
289 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2795  hypothetical protein  44.03 
 
 
286 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  49.3 
 
 
288 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  30.29 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  33.68 
 
 
214 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  32.51 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.43 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  32.62 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  34.29 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  30.81 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  28.87 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  33.14 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  28.96 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  30.33 
 
 
211 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  28.37 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  27.27 
 
 
206 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  28.35 
 
 
211 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  28.3 
 
 
211 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  26.7 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  26.92 
 
 
216 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  28.65 
 
 
206 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  29.09 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  27.47 
 
 
198 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  27.95 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  29.77 
 
 
202 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  28.81 
 
 
204 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  29.32 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  29.38 
 
 
205 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  31.82 
 
 
216 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  28.57 
 
 
215 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.63 
 
 
238 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  29.32 
 
 
208 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  25.25 
 
 
216 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  32 
 
 
211 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  28.02 
 
 
218 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  27.32 
 
 
222 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  25.81 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  29.73 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  29.73 
 
 
233 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  29.73 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  28.33 
 
 
218 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  29.73 
 
 
204 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  26.34 
 
 
232 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  27.98 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  28.78 
 
 
218 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  28.16 
 
 
216 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  25.98 
 
 
212 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  29.12 
 
 
204 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  25.27 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  26.46 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  28.29 
 
 
218 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  28.29 
 
 
218 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  26.41 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  26.05 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  29.1 
 
 
223 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  25.96 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  26.5 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  24.24 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  29.63 
 
 
214 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  29.63 
 
 
214 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  25.55 
 
 
245 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  29.63 
 
 
214 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  25.99 
 
 
280 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  31.15 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  25.67 
 
 
242 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  25.45 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  28.34 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  28.34 
 
 
198 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  26.05 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  27.92 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  28.9 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  28 
 
 
219 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  27.72 
 
 
198 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  23.59 
 
 
193 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  28.19 
 
 
198 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  28.09 
 
 
199 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.04 
 
 
789 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  28.04 
 
 
224 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>