155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3045 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  69.11 
 
 		 206 aa  288  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  70.37 
 
 		 198 aa  287  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  70.16 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  70.9 
 
 		 198 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  69.84 
 
 		 198 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  71.2 
 
 		 198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  65.96 
 
 		 198 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  58.42 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  56.48 
 
 		 193 aa  225  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  42.86 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  35.9 
 
 		 204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  35.08 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  37.21 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  35.05 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  36.63 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  35.57 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.88 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  34.88 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  34.88 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  31.48 
 
 		 216 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  37.21 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  37.21 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  37.21 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  32.62 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  35.56 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  31.79 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  29.26 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  28.27 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  28.27 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  29.95 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  31.21 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  34.78 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  32.8 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  34.18 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  28.8 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  31.48 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  34.66 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  30.56 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.65 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  32.5 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  30.17 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  32.98 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  28.49 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  31.94 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  30.23 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  33.74 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  32.87 
 
 		 285 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  34.58 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  30.89 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  32.79 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  29.41 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  32.8 
 
 		 288 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  31.63 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  31.63 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  31.63 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.43 
 
 		 772 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  31.28 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  35.71 
 
 		 229 aa  87.8  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.39 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  31.93 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  29.05 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  30.37 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  32.81 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  31.52 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.08 
 
 		 238 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3109  hypothetical protein  33.67 
 
 		 285 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  28.89 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  35.05 
 
 		 289 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  32.09 
 
 		 283 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  31.02 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  32.32 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.4 
 
 		 761 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  31.55 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  31.55 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  33.16 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  34.04 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.78 
 
 		 789 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2795  hypothetical protein  30.61 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  31.02 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  31.55 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  29.31 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  28.96 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  32.09 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  30.05 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  31.91 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  30.36 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  31.11 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  31.55 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.94 
 
 		 789 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  30.06 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  29.17 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  28.18 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 		 789 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  28.98 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>