138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2652 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  466  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  95.05 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  53.55 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  48.91 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  40.1 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  42.19 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  42.64 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  42.64 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  42.64 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  39.9 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  38.19 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  39.15 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  34 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  29.95 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  30.46 
 
 		 198 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  35.56 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  35.2 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  35.56 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  35.2 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  33.86 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  34.08 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  32.95 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  31.21 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  33.16 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  33.12 
 
 		 177 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  31.11 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  32.78 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  30.64 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  32.04 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  33.15 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  31.88 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  29.48 
 
 		 198 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  33.73 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  33.15 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  32.68 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  32.6 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  31.4 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32 
 
 		 761 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  30.46 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  32.58 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  27.41 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.69 
 
 		 752 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  33.52 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  29.48 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  31.67 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  31.22 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.62 
 
 		 790 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  31.11 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.68 
 
 		 781 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  29.52 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  31.84 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  32.22 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  31.84 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  31.28 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  32.24 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.81 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  26.63 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  29.95 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  32.2 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  25.76 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  31.61 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  31.87 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  31.35 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  31.35 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  31.55 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.6 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2656  hypothetical protein  24.88 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.95 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  30.22 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  33.9 
 
 		 757 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.19 
 
 		 789 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.09 
 
 		 789 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  28.64 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  32.04 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  29.05 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  28.65 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  30.95 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  29.94 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  29.94 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  29.94 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  27.84 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.09 
 
 		 789 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.83 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  30.5 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  27.71 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  30.36 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  27.11 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  30.15 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  28.83 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  27.11 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  29.28 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40950  predicted protein  27.73 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  27 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  25.84 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>