152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4448 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  83.92 
 
 
211 aa  356  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  70.56 
 
 
202 aa  293  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  68.5 
 
 
223 aa  279  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  66.5 
 
 
214 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  66.5 
 
 
214 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  66.5 
 
 
214 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  64.5 
 
 
221 aa  271  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  65.33 
 
 
224 aa  271  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  64.82 
 
 
238 aa  267  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  62.94 
 
 
211 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  60.3 
 
 
214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  64.06 
 
 
199 aa  260  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  62.69 
 
 
210 aa  260  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  61.62 
 
 
214 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  59.9 
 
 
206 aa  255  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  59.9 
 
 
206 aa  255  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  56.25 
 
 
211 aa  251  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  58.88 
 
 
216 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  58.38 
 
 
216 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  53.2 
 
 
211 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  55.12 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  54.63 
 
 
216 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  58.38 
 
 
215 aa  241  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  56.72 
 
 
218 aa  241  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  57.92 
 
 
214 aa  241  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  57.64 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  52.4 
 
 
212 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  56.22 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  56.16 
 
 
218 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  56.16 
 
 
218 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  57.07 
 
 
213 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  53.03 
 
 
211 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  55.72 
 
 
217 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  54.08 
 
 
214 aa  231  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  57.89 
 
 
229 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  55.1 
 
 
205 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  54.23 
 
 
232 aa  228  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  54.23 
 
 
211 aa  225  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  53.06 
 
 
205 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  54.59 
 
 
211 aa  223  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  53.33 
 
 
212 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  52.02 
 
 
211 aa  222  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  55.1 
 
 
211 aa  222  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  50.76 
 
 
219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  53.61 
 
 
216 aa  214  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  52.94 
 
 
212 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  52.94 
 
 
235 aa  208  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  51.08 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  57.33 
 
 
179 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  37.24 
 
 
243 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  35.89 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  34.76 
 
 
251 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.18 
 
 
270 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  34.12 
 
 
251 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  33.84 
 
 
278 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  33.67 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  34.13 
 
 
244 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  34.54 
 
 
270 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  32.82 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  31.19 
 
 
245 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  31.63 
 
 
270 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  30.39 
 
 
257 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  32.65 
 
 
269 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  32.23 
 
 
245 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  36.52 
 
 
204 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  36.52 
 
 
204 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  30.1 
 
 
279 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  36.46 
 
 
204 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  31.79 
 
 
280 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  32.14 
 
 
270 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  31.09 
 
 
275 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  33.16 
 
 
274 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  31.94 
 
 
273 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  28.14 
 
 
257 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  29.67 
 
 
251 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  29.67 
 
 
251 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  29.67 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  31.41 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  30.32 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  33.15 
 
 
280 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  27.96 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  34.46 
 
 
277 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  34.65 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  28.1 
 
 
245 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  30.23 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  28.79 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  32.79 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  31.25 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  29.74 
 
 
268 aa  88.2  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  29.35 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.28 
 
 
781 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  31.02 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  27.17 
 
 
241 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  29 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>