144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1839 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  82.67 
 
 
223 aa  349  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  70.91 
 
 
221 aa  315  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  68.87 
 
 
224 aa  304  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  72.96 
 
 
202 aa  300  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  65.28 
 
 
238 aa  291  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  65.8 
 
 
199 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  66.5 
 
 
208 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  61.31 
 
 
211 aa  254  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  58.91 
 
 
210 aa  246  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  54.77 
 
 
211 aa  238  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  53.85 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  53.85 
 
 
214 aa  234  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  53.14 
 
 
217 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  52.28 
 
 
214 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  51.22 
 
 
232 aa  225  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  50.26 
 
 
211 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  47.39 
 
 
216 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  51.28 
 
 
216 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  52.76 
 
 
215 aa  221  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  49.5 
 
 
211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  52.58 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  50.26 
 
 
212 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  51.53 
 
 
206 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  51.53 
 
 
206 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  51 
 
 
214 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  51.72 
 
 
214 aa  214  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  50 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  49.04 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  50.74 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  53.16 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  45.97 
 
 
216 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  45.97 
 
 
216 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  49.77 
 
 
219 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  49.75 
 
 
218 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  49.49 
 
 
205 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  48.5 
 
 
205 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  53.19 
 
 
217 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  48.15 
 
 
216 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  48.5 
 
 
211 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  49.01 
 
 
211 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  49.2 
 
 
212 aa  201  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  49.28 
 
 
218 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  49.28 
 
 
218 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  49.76 
 
 
218 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  48.47 
 
 
211 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  45.59 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  49.11 
 
 
179 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  33.02 
 
 
243 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  34.25 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  33.83 
 
 
245 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  34.7 
 
 
251 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  35.96 
 
 
244 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  34.33 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  34.98 
 
 
244 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  29.82 
 
 
257 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  36.31 
 
 
277 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  31.88 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  31.88 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  31.88 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  30.93 
 
 
245 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  31.78 
 
 
242 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  32 
 
 
270 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  29.38 
 
 
274 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  31.94 
 
 
245 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  29.36 
 
 
257 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  33.85 
 
 
273 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  36.51 
 
 
204 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  31.47 
 
 
239 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  32.35 
 
 
270 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  32.65 
 
 
270 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  29.22 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  30.3 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  30 
 
 
279 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  31.79 
 
 
273 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  29.9 
 
 
248 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  28.08 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  31.13 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  30.85 
 
 
269 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  30.56 
 
 
274 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  30.2 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  30.23 
 
 
280 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  30.46 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  30.14 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  31.82 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  31.63 
 
 
195 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  32.45 
 
 
200 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  31.72 
 
 
198 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  29.47 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  29.06 
 
 
268 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  32.68 
 
 
277 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  28.34 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  31.72 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  28.34 
 
 
241 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  31.38 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>