153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0607 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  83.92 
 
 		 208 aa  356  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  66.83 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  67.37 
 
 		 202 aa  269  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  62.25 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  64.47 
 
 		 210 aa  259  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  61.93 
 
 		 214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  61.93 
 
 		 211 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  61.31 
 
 		 214 aa  254  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  61.31 
 
 		 214 aa  254  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  61.31 
 
 		 214 aa  254  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  62.94 
 
 		 206 aa  254  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  62.94 
 
 		 206 aa  254  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  63.78 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  60.2 
 
 		 224 aa  250  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  62.3 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  61.5 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  58.71 
 
 		 216 aa  248  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  59.09 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  58.21 
 
 		 218 aa  246  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  57.71 
 
 		 218 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  59.39 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  55.78 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  57.71 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  58.46 
 
 		 216 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  57.71 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  57.71 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  60.31 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  55 
 
 		 211 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  57.07 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  57.44 
 
 		 216 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  54.77 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  56.5 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  57.29 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  54.95 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  55.73 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  56.19 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  56.02 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  54.27 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  56.77 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  54.12 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  55.22 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  56.77 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  54.77 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  49.75 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  55.08 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  53.93 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  52.58 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  48.97 
 
 		 217 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  57.62 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  37.5 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  38.64 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  38.31 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  35.82 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  34.83 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  36.73 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.65 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  34.36 
 
 		 269 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  32 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  36.11 
 
 		 278 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  36.76 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.97 
 
 		 270 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  31.19 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  33 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  34.66 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  35.05 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  36.32 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  36.32 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  36.32 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  36.9 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  36.9 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  29.7 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  34.34 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  29.7 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  29.7 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  31.58 
 
 		 279 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  32.6 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  29.9 
 
 		 257 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  33.82 
 
 		 280 aa  94.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  31.63 
 
 		 280 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  32.63 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  32.65 
 
 		 273 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.9 
 
 		 277 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  34.01 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  30.73 
 
 		 275 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  32.82 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  29.59 
 
 		 268 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  29.9 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  28.57 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  29.65 
 
 		 276 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  30.32 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  29.61 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  30.32 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  30.99 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  29.31 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  30.99 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  30.99 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>