156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3976 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  94.15 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  89.64 
 
 		 213 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  83 
 
 		 214 aa  357  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  83.33 
 
 		 211 aa  348  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  84.82 
 
 		 211 aa  347  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  83.85 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  70.24 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  69.76 
 
 		 218 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  69.15 
 
 		 218 aa  290  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  68.66 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  68.66 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  66.19 
 
 		 232 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  68.91 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  66.67 
 
 		 219 aa  284  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  67.01 
 
 		 215 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  64.73 
 
 		 217 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  66.49 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  63.27 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  66.32 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  66.15 
 
 		 211 aa  268  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  65.64 
 
 		 212 aa  267  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  58.03 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  57.92 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  56.5 
 
 		 214 aa  240  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  57.95 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  57.95 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  56.7 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  56.44 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  52.2 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  55 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  54.59 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  53.06 
 
 		 208 aa  224  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  54.59 
 
 		 216 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  54.08 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  54.08 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  73.65 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  54.08 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  53.57 
 
 		 214 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  54.12 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  51.3 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  48.5 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  48.5 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  48.5 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  49 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  49.74 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  48.65 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  46.19 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  34.65 
 
 		 243 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  37.11 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  38.17 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  34.18 
 
 		 244 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  32.84 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  37.97 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  32.51 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  32.66 
 
 		 278 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  34.03 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  31.5 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  36.54 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.41 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  35.87 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  32.06 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  35.9 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  34.65 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  32.52 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  34.22 
 
 		 273 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  35.9 
 
 		 274 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  32.47 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  34.76 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  30.24 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  30.24 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  32.66 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  29.76 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.34 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  31.25 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  29.32 
 
 		 280 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  34.9 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  34.41 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  33.82 
 
 		 280 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.5 
 
 		 781 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  31.66 
 
 		 248 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  31.66 
 
 		 248 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  33.17 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  30.15 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  33.86 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  31.79 
 
 		 238 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  30.15 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  29.61 
 
 		 257 aa  89  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  29.41 
 
 		 287 aa  88.2  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  30.33 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>